入窖贮藏用大屋窖或地窖，瓜种入窖前需对旧窖严格消毒，可用50％多菌灵600倍液或5％安索菌毒清水剂500倍液喷洒。存放地瓜时，每存一层地瓜，用“地瓜保险剂”稀释液均匀喷洒一遍。瓜种入窖前期（入窖15—20天），应先加温18—24小时，使窖内温度达到35℃—38℃，保持四昼夜，随后打开天窗排湿降温，经18—24小时使窖温降至15℃。贮藏中期（入窖后20天到第二年春2月初），主要保温、升温，窖温应稳定在12℃—13℃。贮藏后期（2月初到育苗）及时开窖检查，排除多余二氧化碳。用以上方法储藏的地瓜保鲜时间长，完好率达96％以上。