胚根又称初生根或种子根。由胚伸出的一条幼根称主胚根,经1—3天后又陆续长出3—7条幼根,称次生胚根。主胚根和次生胚根组成初生根系,是幼苗期的主要根系,随后其功能渐为地下节根所替代。长在地下茎节上的根叫节根,亦叫次生根。当幼苗长出2—3片叶时,开始发生第一层地下节根,以后随着茎叶的生长,节根依次向上发生,一般有4—7层,因品种和肥水条件不同而异。地下节根是玉米最主要的根系,对玉米中后期的生长起重要作用。地上节根在分枝后开始生长,暴露在空气中,根系粗壮坚硬,含有色素,具有固定植株的作用。玉米根系分为三种:初生根、次生根、气生根。次生根主要负责养分吸收,气生根起固定支持防倒伏,兼有水分吸收作用。玉米的根为须根系,分胚根和节根,节根从茎节上长出:从地下节根长出的称为地下节根,一般4~7层;从地上茎节长出的节根又称支持根、气生根,一般2~3层。促进根系生长,防止根系早衰,增强植株抗倒能力是制定玉米高产栽培措施的重要内容。