小麦胞囊线虫病是一种定居型内寄生性线虫病害，其整个为害阶段都在根输导组织处进行。当环境温度在9℃以上时，有利于线虫孵化和侵入寄主。2龄幼虫侵入幼嫩根尖，头部插入后在维管束附近定居取食，刺激周围细胞形成巨形细胞。随后，2龄幼虫发育为豆荚型，蜕皮形成长颈瓶形3龄幼虫，4龄为葫芦形，最终成为柠檬形成虫。在根皮被侵染处，形成白色胞囊，内含大量卵。孢囊可借流水、风力进行远距离传播。
一般与禾谷类作物连作发病较重，轻沙质土比粘土发病更重。雄成虫由定居型变为活动型，离开根部与雌虫交配后死亡。雌虫体内充满卵及胚胎卵变为褐色胞囊后死亡。
