山药褐斑病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。设计畦向时要考虑种植地的通透性，避免株行间郁蔽高湿。连阴雨天注意清沟排渍。收获后及时清除病残体，集中烧毁。再结合化学药剂防治。
秋收后及时清洁田园，把病残体集中深埋或烧毁。合理轮作，做好肥水管理。发病初期喷施50%代森锰锌可湿性粉剂600倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液，每10-15天喷洒1次，视病情交替用药连喷3-4次，效果更佳。
从6月下旬起，为预防发病，每隔7～10天喷一次1:1:200波尔多液，连喷2～3次。发病初期喷65%代森锌500倍液，每隔7天喷1次，连喷2～3次。
选地势较高，通风良好地块种植。因地制宜设计垄（畦）向，注意密度不要过大，避免株行间郁蔽。做好肥水管理，防止植株早衰。阴雨天注意清沟排渍。收获后及时清除病残体，集中烧毁或深埋，并深翻土壤。
发病初期及时喷布药剂防治，药剂可选用70％甲基托布津可湿性粉剂800倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂500倍液，或40％多硫悬浮剂500倍液，或80％喷克可湿性粉剂500倍液，或68％倍得利可湿性粉剂800倍液，或80％大生可湿性粉剂800倍液。
