豆秆黑潜蝇一般一年发生4代，尤其是2-3代量大危害重。越冬代成虫盛期在6月上旬。第一代幼虫盛期在6月末，在春播大豆上蛀食为害，成虫盛期在7月中旬，此时迁入夏大豆繁殖。第二代幼虫盛期在7月末8月初，蛀食为害初花期大豆，成虫盛期在8月中旬，此时大豆盛花期。第三代幼虫在8月中旬，大豆末花至初荚期，亦是危害最盛；成虫盛期在9月上旬。第四代幼虫盛期在9月中旬末，为害晚播大豆和绿豆。在山东，年发生5代，以蛹在寄主根茬和秸秆中越冬。翌年6月中下旬羽化、产卵。各代幼虫盛发期：1代7月上旬；2代7月末8月初；3代8月下旬；4、5代在9月上中旬重叠发生。
成虫飞翔力、趋化性均较弱，在25~30丈适温下，多集中在豆株上部叶面活动，常以腹末端刺破豆叶表皮，吸食汁液，致使叶面呈白色斑点的小伤孔。卵单粒散产于叶背近基部主脉附近表皮下，以中部叶片着卵多。幼虫孵化后即在叶内蛀食，形成一条极小而弯曲稍透明的隧道，沿主脉再经小叶柄、叶柄和分枝直达主茎，蛀食髓部和木质部。幼虫老熟后，在茎壁上咬一羽化孔，而后在孔口附近化蛹。
