紫纹羽病主要为害根部，初发生于细支根，逐渐扩展至主根、根颈。发病初期，根的表皮出现黄褐色不规则的斑块，病处较健根的皮颜色略深，内部皮层组织已变成褐色。不久，病根表面缠绕紫红色网状物，甚至满布厚绒布状的紫色物，后期表面着生紫红色半球形核状物。病根皮层腐烂，由褐色变为黑色，而表皮仍完好地套在木质部的外面，可滑动脱落，最后木质朽枯，栓皮呈鞘状套于根外，捏之易碎裂，烂根具浓烈蘑菇味。苗木、幼树、结果树均可受害。轻病树树势衰弱，叶黄早落；重病树枝条枯死甚至全株死亡。病根周围的土壤也能见到菌丝块。
地上部的症状是叶片变小、黄化，叶柄和中脉发红，枝条节间短，病株生长衰弱。由于根部腐烂，地上部的枝蔓长势衰弱，节间短、叶片小、颜色发黄而薄，病情发展较缓慢，病株枯死往往需要几年的时间。植株地上部树势衰弱，新梢生长量少，叶小型，色淡，夏天时萎蔫、变黄，早脱落，连续2～3年表现同样症状，数年后死树。地上部分症状显著，约3/4的根表被侵染，根颈表面有紫褐色物。有的植株生长很正常，突然叶变黄、落叶，植株随即枯死。根状物沿根表面向上蔓延。地上部分植株生长茂盛和高湿度条件下，树干的很多部位出现紫褐色物。
秋季在病树根部周围的土层中特别是缝隙处，可见大小形状不定的紫色菌丝块，其内有时还夹杂着病残组织或沙土。病部及附近土壤有浓烈的蘑菇味。紫纹羽病发展较缓慢，病树往往要经过数年后才死亡。
