加强鸡舍消毒，供给充足的饮水，在饮水中添加5%的糖和0.1%的食盐，以提高鸡群的抗病能力。1日到7日日龄的雏鸡用弱毒疫苗进行一次饮水免疫；24日日龄的鸡群再进行一次免疫。加强管理，搞好卫生消毒工作，防止外来病原传入鸡场。一旦发生本病，及时处理病鸡并进行彻底消毒。鸡舍可用烟客烟熏消毒，门前消毒池宜用复合酚溶液，每2～3周换一次，也可用清净农场癸甲溴铵，每周换一次。
预防接种是预防鸡传染性法氏囊病的有效措施。种鸡首免根据抗体测定结果确定，一般在10-14日龄进行弱毒苗滴口，二免在首免后2周进行，使用中等毒力疫苗滴口或饮水，疫苗中加0.2%-0.5%脱脂奶粉或2%鲜牛奶（煮熟去皮用）。种鸡在18-20周龄和40-42周龄时用灭活单苗或多价苗接种。雏鸡首免在20-24天，间隔14天进行二免。蛋鸡和肉鸡中未接种过的小鸡，10-14天进行首免，间隔14天进行二免。种鸡接种过的小鸡，第一次接种在20-24天，14天后进行二免，无需注射灭活苗。肉鸡若在60天内未出售，法氏囊高发地区需进行二免。
鸡传染性法氏囊炎的预防措施包括加强鸡舍消毒和饲养管理。可在10-14日龄使用传染性法氏囊炎弱毒疫苗或中等毒力疫苗进行饮水免疫，25-32日龄进行二次免疫。
