深翻土壤，使菌核不能萌发，并实行轮作，培育无病苗。及时清除田间杂草，有条件的覆盖地膜，抑制菌核萌发及子囊盘出土。发现子囊盘出土，及时铲除，集中销毁。加强管理，注意通风排湿，减少传播蔓延。棚室采用烟雾法或粉尘法，于发病初期，亩用10%速克灵烟剂250-300克熏1夜，也可于傍晚喷洒5%百菌清粉尘剂，每亩次1公斤，隔7-9天1次。发病初期立即喷药，可选用40%菌核净可湿性粉剂500倍液，或50%速克灵可湿性粉剂1500倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1500倍液。植株茎的基部和地面上应喷洒药液，隔7-8天一次，连续防治3-4次。发病初期用50%托布津可湿性粉剂400倍液；50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，每10天喷药一次，共2-3次。
土壤消毒处理：番茄收获后，深翻20㎝以上，将病菌翻入土壤深处，减少危害。移栽前，使用50%腐霉利可湿性粉剂1kg/667平方米，对细土20kg拌匀耙入土中消毒。培育无病壮苗：结合净种和净土，用55℃温水泡种子半小时，或用10%盐水漂洗种子2-3次，杀死病菌，定植前淘汰病苗。加强田间管理：根据品种特性合理密植，采用滴灌浇水，增施磷肥、钾肥，提高抗病性能。及时摘除病叶、病枝、病果，适时打老叶，收获后清理病株残体。药剂防治：发病初期喷雾防治，使用50％乙烯菌核利可湿性粉剂(农利灵)1000倍。
