稻曲病防治难度较大，一是选择抗病品种。二是选择有效药剂，如井农抗等。三是适期防治，破口前5到7天。四是注意防治喷雾方法，要喷细雾，喷均匀。五是注意水肥管理，合理施用N肥。在水稻孕穗破口期，可用5%井冈霉素水剂100～150毫升/亩对水50～75千克喷雾，或43%戊唑醇悬浮剂10～15毫升/亩兑水40～50千克喷雾，或5%己唑醇悬浮剂40～60毫升/亩兑水40～50千克。此外，可采用烯唑醇+井冈霉素、烯唑醇+三环唑、井冈霉素+戊唑醇、井冈霉素+枯草芽孢杆菌、井冈霉素+三唑酮、井冈霉素+嘧啶核苷类抗菌素等复配方法防治水稻稻曲病。