以防治幼果疮痂病为重点，于花谢2/3时喷药，发病条件特别有利时可在半个月后再喷一次。春芽期(芽长2毫米)最好根据预报来决定是否用药。有效的药剂品种有波尔多液(硫酸铜0.5～1千克，石灰0.5～1千克，水100千克)、55%硫菌霉威可湿性粉剂1000～1200倍液、50%多霉清可湿性粉剂800～1000倍液、77%可杀得2000型800倍液、80%必备可湿性粉剂400～600倍液、80%山德生(大生M-45)可湿性粉剂600倍液、30%二元酸铜可湿性粉剂400～500倍液、20%龙克菌(杀菌铜)胶悬剂500倍液、12%绿菌灵乳油500倍液。
防治该病一般要用2~3次药。第1次要掌握在春芽萌动时进行，即芽的长度不超过1厘米长以前，否则容易引起药害。这是保护新梢的关键。第2次施药要掌握在橘树2/3的花瓣脱落时，这是保护幼果的关键。第3次防治可以根据具体情况确定。如6月份有连续霉雨趋势，幼果上病斑仍在发展时，可在6月中旬防治1次。苗木疮痂病主要掌握各次树梢抽芽前防治。目前，防治疮痂病以波尔多液为最好。
