玉米黑粉病为害植株地上部的茎、叶、雌穗、雄穗、腋芽等幼嫩组织。受害组织受病原菌刺激肿大成瘤。病瘤未成熟时，外披白色或淡红色具光泽的柔嫩组织，以后变为灰白或灰黑色，最后外膜破裂，放出黑粉即病菌厚垣孢子。玉米黑粉病又名瘤黑粉病，在玉米整个生育期内，玉米都可能会受到黑粉病的侵染，尤其是抽穗前后一个月内，受侵染的玉米会生长出肿瘤，失去玉米的食用价值，严重影响玉米的产量和品质。
玉米黑粉病侵染时间长，病菌从苗期到成株期都能侵染玉米。玉米在不同生长阶段，以及不同侵染部位，症状表现有所差异。病瘤形状和大小因发病部位不同而异。叶片和叶鞘上瘤大小似豆粒，不产生或很少产生黑粉。茎节、果穗上瘤大如拳头。同一植株上常多处生瘤，或同一位置数个瘤聚在一起。植株茎秆多扭曲，病株较矮小。受害早，果穗小，甚至不能结穗。该病能侵害植株任何部位，形成肿瘤，破裂后散出黑粉，别于丝黑穗病。丝黑穗病一般只侵害果穗和雄穗，并有杂乱的黑色丝状物。
玉米黑粉病会造成玉米茎、叶及腋芽受到病害的感染，严重影响玉米的产量。玉米被害的病株会生出灰黑色的病斑，初期病株外有层白色薄膜，渐渐变成灰色，干裂后会散发出黑色的粉状物，及玉米病原菌孢子。
