种植菜椒的季节应选择春天1月底至2月初，或者秋天8月初进行播种。首先，选择肥沃、富含有机质的沙性土壤，整地后施足基肥，起垄做沟。种植前应先播种育苗，然后移栽定植，按照行间距和株间距均为30cm左右进行种植。如气温较低，需覆膜保温，种植好后及时浇水。
菜椒苗不耐涝、不耐旱，所以在管理上需要确保田间没有积水，及时的将水排出以防泡腐根部。如果土质属于沙壤土采取小水灌溉的方式，增加灌溉次数，而粘质土相反，需要大水灌溉，浇水的次数减少。定植后4.5天根据情况适当的浇水，追肥。整枝和防治病虫害也是重要的管理措施。
防治措施包括选用抗病品种，小麦收获后及时翻耕，消灭自生麦苗，减少夏菌源。合理密植，合理施肥，不偏施氮肥。发病初期选用15%粉锈宁75克／亩兑水45千克喷雾防治，间隔7―10天，连防3次。