苹果腐烂病有三种类型：溃疡型、枝枯型和表面溃病型。
溃疡型在早春时，树干和枝树皮上会出现红褐色、水渍状、微隆起、圆至长圆形的病斑。这些病斑质地松软，容易撕裂，手压会凹陷，并流出黄褐色汁液，伴有酒糟味。随后病斑会干缩，边缘有裂缝，并在病皮上长出小黑点。在潮湿条件下，这些小黑点会喷出金黄色的卷须状物。
枝枯型在春季时，2～5年生的枝条上会出现病斑，这些病斑边缘不清晰，不隆起，也不呈水渍状。随后，枝条会失水干枯，并密生小黑粒点。
表面溃病型在夏秋季节的落皮层上表现为稍带红褐色、稍湿润的小溃疡斑。这些溃疡斑边缘不整齐，通常深度为2～3厘米，大小从指甲大小到几十厘米不等。随着病程的发展，溃疡斑会腐烂后干缩，形成饼状。到了晚秋，这些溃疡斑会形成明显的溃疡斑。
