高畦双行种植，合理施肥，忌偏施氮肥，增施磷、钾肥，提高植株抗病力。收获后翻耕菜地，深埋菌核，消灭菌源。喷洒杀菌剂：40%菌核净可湿性粉剂1000倍液；25%多菌灵可湿性粉剂500倍液；70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，50%腐霉利可湿性粉剂等，以上几种药剂轮换使用，每隔7到10天用一次，连续2到3次。冬季清园，结合施肥进行翻耕。开春后，搞好水肥供应。保持通风透光。发病初期，用多菌灵，甲基托布津，甲基硫菌灵等药剂防治。
莴笋菌核病的防治方法：选择抗病品种，并选择苗龄6叶~8叶期带土定植。可用营养钵或营养土块育苗，带土移栽，提高成苗率和抗病性。还可以使用杀菌药剂进行拌土，能够有效提高莴笋抗病能力。选择50%速克灵可湿性粉剂每公顷用药量1500克，对水喷雾；40%纹枯利可湿性粉剂800-1200倍液。50%农利灵可湿性粉剂每公顷用药量1500克，对水喷雾；25%施保克乳油，每公顷1050毫升，对水喷雾。一般于发病初期防治一次，7~10天后再喷一次。
