发病症状表现在幼茎基部产生水溃状腐烂,病部暗绿色,最后呈猝倒状或立枯状死亡。成株期感病,根茎部和茎、枝条出现水溃状暗绿色病斑,后期变黑褐色,皮层软化腐烂,病部以上枝叶萎凋死亡或折倒。叶片发病,产生圆形或不规则形大块暗绿色湿腐斑,干燥后病斑变淡褐色,叶片脱落。果实染病始于蒂部,初生暗绿色水溃状斑,迅速变褐软腐。干燥时,病斑变淡褐色而枯缩。苗期发病,茎基部呈暗绿色水浸状软腐或猝倒,即苗期猝倒病;有的茎基部呈黑褐色,幼苗枯萎而死。成株期发病,根部染病,主根染病,初呈淡褐色湿腐状斑块,后逐渐变为黑褐色,导致根及跟颈部韧皮部腐烂,木质部变淡褐色,引起整株萎焉死亡,可称为"根腐型",常和辣椒根腐病相混。茎和枝染病,病斑初为水浸状,环茎枝表皮扩展的,后导致茎枝"黑杆",病部以上枝叶迅速凋萎。叶片染病,出现污褐色边缘不明显的病斑,病叶很快湿腐脱落。果实染病,特别是菜椒,多始于蒂部,初生暗绿色水浸状斑,病果迅速变褐软腐,湿度大时病果表面长出白色霉层,干燥后形成暗褐色僵果,残留在枝上。