梨树的根系与桃树、苹果比较，具有分布深而稀少的显著特点。根系分布情况因树龄和栽植密度而异，一般情况下，梨根系分布在深100厘米左右的土层内。沙壤土通气良好、土壤肥沃，根系发育好；而土壤粘重、通气不良则分根少、生长弱。在有胶泥层的梨园，梨根系生长受阻。
梨树的吸收根主要分布在土层20公分以下，40公分以上。如果表层土壤肥沃疏松，而犁底层上移并坚硬，根系会上移，导致抗旱性变差。不同砧木对梨根系生长影响明显。例如，以山梨为砧的锦丰梨根系密集多分根，而以杜梨为砧则根系稀疏，分布广远。
成龄梨树在年周期内有两次生长高峰，第一次在新梢旺盛生长之后的缓慢生长时；第二次在采收后。根系生长受温度、水分、通气、矿质营养、树体营养等条件影响。春季根系生长对果实膨大至关重要，直接影响当年产量和品质；秋季采后的根发育则有助于树体积累营养，为次年早春开花、坐果及叶幕的形成提供支持。梨园土壤管理主要目标是促进根系健康成长。地面覆盖秸草，夏季可降低地温，冬季可提高地温，有利于表层根的发育；改良土壤、深翻深锄可提高土壤通气性，有利于深层根的发育。
过量负载会导致树体营养亏损，根发育不良，进而影响吸收功能，使树体进入衰弱和低产的恶性循环。此外，地膜覆盖会抑制土壤水分蒸发，冬天保持土壤温度，夏天适当降低土壤温度，有利于吸收根的生发，抗春旱效果较好，因此更适合在北方年降雨量少或果树生长季节降水不均衡地区采用。
