蚕豆根腐病主要为害根和茎基部，引起全株枯萎。发病初期，主根和茎基部出现水渍状斑，随后发展为黑色腐烂，侧根枯朽，皮层易脱离。烂根表面形成致密的白色霉层，这是病菌的菌丝体，后期霉层变为黑色颗粒，即病菌的菌核。病茎水分蒸发后，干枯变灰白，表皮破裂如麻丝，内部有时也有鼠粪状黑色颗粒。
蚕豆根腐病的发病过程主要分为两个阶段：第一阶段为根腐，主要表现为根颜色的变化，初期蚕豆主根及须根由红色变为褐黑色，须根逐渐死亡；第二阶段为茎基腐，由病原菌扩展引起，茎秆部位由健康的绿色逐渐变为水浸状，最终变为黑色。若发病条件适宜，可能仅出现第一阶段，表现为植株青枯，无产量；若两阶段均发生，植株长势较弱，虽可结荚，但产量极低。