1、与非瓜类作物实行2年以上轮作，加强田间管理，生长期及收获后清除病叶，及时深埋。
2、选用耐病冬瓜品种，从无病株上选留种。瓜种可用70℃恒温热灭菌72小时，或50℃温水浸种20分钟捞出晾干后催芽播种；也可用40%福尔马林150倍液浸种1.5小时，或100万单位硫酸链霉素500倍液浸种2小时，冲洗干净后催芽播种。
3、在冬瓜细菌性角斑病发病初期，喷洒72%农用硫酸链霉素4000～5000倍液，或47%加瑞农可湿性粉剂800～1000倍液，或77%氢氧化铜可湿性粉剂500倍液。
4、保护地冬瓜重点抓好生态防治，须用药时可选用粉尘法：喷撒10%乙滴粉尘剂，或5%百菌清或10%脂铜粉尘剂，每667m²用1kg。
5、露地推广避雨栽培，开展预防性药剂防治，于发病初期或蔓延开始期喷洒72%农用硫酸链霉素或新植霉素4000～5000倍液、47%加瑞农可湿性粉剂800～1000倍液、14%络氨铜水剂300倍液、77%可杀得可湿性粉剂500倍液。
