西瓜枯萎病是由半知菌亚门真菌，西瓜尖镰孢菌侵染所致。病菌在土壤中和未腐熟的带菌肥料中越冬，在离开寄主的情况下，能存活5-6年，部分病菌可存活10年以上。西瓜枯萎病菌主要通过根部伤口或根毛顶端细胞间隙侵入，先在寄主管壁细胞间和细胞内生长，然后进入维管束，在导管内发育，病菌分泌果胶酶和纤维素酶，分解破坏细胞，使导管内积累果胶类物质，堵塞导管，影响水分运输，引起植株萎蔫。该病主要靠含菌土壤传播，重茬种植，土壤中病菌多，病株率可达70%左右，病残体及病粪，种子亦可传病。
防治西瓜枯萎病最有效的方法是嫁接换根，用葫芦或新土佐等高抗枯萎病的葫芦科作物做砧木嫁接西瓜品种，只要注意彻底断掉西瓜根，苗子栽植时，不使嫁接口部位与土壤接触，就会有效地防止西瓜枯萎病的发生。具体防治措施如下：
1、选择抗病品种。种植抗病西瓜品种是首选措施，如选用西农八号、丰抗八号等品种。
2、嫁接栽培。由于西瓜枯萎病病菌难以侵染葫芦、瓠瓜、南瓜等，以这些作物为砧木进行嫁接换根，这种方法是解决西瓜枯萎病的较好途径。
3、种植地轮茬间隔五年以上，选用抗病品种，种籽消毒，严禁用带病苗子，用嫁接苗，控制浇水，发现病株及时拔除集中处理，用新鲜石灰粉土壤消毒，用抗菌剂喷打防治。
