预防病毒性腹泻可用传染性胃肠炎和流行性腹泻二联弱毒苗，方法是母猪临产前15天和产后7天对母猪进行2次免疫，仔猪通过母乳获得被动免疫力。应用C型产气荚膜福尔马林氢氧化铝类毒素，对临产前1个月母猪肌注5毫升，产前半个月再加注10毫升，或对怀孕后期母猪注射C型魏氏梭菌苗。预防黄、白痢，可用大肠杆菌基因工程苗（有二价、三价、四价苗，按说明使用）。预防仔猪副伤寒，可在30日龄口服副伤寒菌苗。
合理配制仔猪料，既要保证仔猪的生长需求，又不要蛋白质含量过高，特别是植物蛋白不能过高。适当添加纤维饲料，断奶仔猪饲料中适当添加纤维（3%～5%为宜），如草粉等，除了促进肠道发育外，挥发性脂肪酸可以通过大肠对水的吸收和抑制有害菌的生长，维持胃肠道消化功能。
药物预防方面，每吨饲料中添加枝原净100克+金霉素400克或强力霉素150克，饲喂1周；或每吨饲料中添加二甲硝咪唑100克；或饲料中按1%～2%添加中草药半边莲草粉。
完善管理体系，搞好卫生防疫工作，加强消毒，提供适宜的环境等。