羊痘的潜伏期通常为5～6天。初期表现为红色或紫红色的小丘疹，质地坚硬，随后发展成顶端扁平的水疱，可能进一步演变为出血性大疱或脓疱，中央有脐凹，大小可达2～3cm，最大可达5cm。这些疹块常融合成片，几天后脱落，可能导致呼吸困难，加速病羊死亡。
轻症病例中，皮肤上散布稀少的痘疹，经过水疱、化脓、结痂过程，最终转为硬结节，俗称“石痘”。痘疹逐渐消失，不留痕迹。山羊羔尤其容易在口腔、舌黏膜及鼻腔发生病变，常伴发脓性感染和坏死杆菌病。
根据病程和症状可进行诊断，该病一般预后良好。康复的山羊将获得终身免疫力。但需注意与传染性脓疱相鉴别。