番茄早疫病主要侵染植株茎、叶、花和果实,在高温多湿条件下容易发病且整个生育期均可染病。番茄脐腐病又称顶腐病,该病只发生在果实上。西红柿病害种类较多,主要病害有病毒病、晚疫病、灰霉病、叶霉病、早疫病和溃疡病等。这些病害在实际生产上常常同时发生,交替发生,发病早、来势猛、流行快、危害重。虫害主要是蚜虫、温室白粉虱和棉铃虫等。苗期容易感染立枯病、枯萎病,害虫有白粉虱、蚜虫、蓟马等。其他常见病害包括番茄叶霉病、番茄灰叶斑病、番茄煤霉病、番茄细菌性髓部坏死病、番茄青枯病、番茄根结线虫病、番茄白粉病和番茄斑萎病毒病。