症状主要危害叶片，也可危害茎蔓、叶柄和果实。幼苗受害时，子叶边缘出现圆形或半圆形褐色或黑褐色病斑，外围常有黑褐色晕圈，病斑上常散生黑色小粒点或淡红色黏状物。近地面茎部受害，茎基部变成黑褐色且缢缩变细，导致植株猝倒。西瓜在生长的各个时期都有可能感病。幼苗期植株感病表现为茎部缢缩，随后变为黑褐色，引起植株猝倒。
叶片受害时，初期为圆形淡黄色水渍状小斑，随后变褐色，有小点和同心轮纹，病斑容易穿孔，外缘常有黄色晕圈，病斑色泽均匀，上面散生小黑点，最后扩大变黑，叶片枯萎凋亡。叶柄和蔓上呈现长椭圆凹陷或梭形病斑，初为水浸状黄褐色，后变黑褐色，随着病痕扩展，茎蔓逐渐死亡。果柄染病时，幼果颜色深暗，逐渐萎缩致死。果实受害后，初为暗绿色油渍状小斑点，随后扩大成圆形暗褐色，表面产生凹陷，并出现有轮纹的病斑，病害严重时，病斑连片，导致西瓜腐烂。
果实染病初期为水浸状凹陷形褐色圆斑或长圆形斑，常龟裂，湿度大时斑上产生粉红色黏状物。西瓜炭疽病主要为害叶片，也可为害茎蔓、叶柄和果实。
