该病属于一种生理病害，由缺钙引起，即植株不能从土壤中吸收足够的钙素，加之其移动性较差，果实不能及时得到钙的补充。当果实含钙量低于0.2%时，致使脐部细胞生理紊乱，失去控制水分能力而发生坏死，并形成脐腐。多数情况下土壤中不缺乏钙元素，主要是氮肥等化学肥料使用过多，使土壤溶液过浓，影响钙素吸收。
防治措施：1. 浇足定植水，保证花期及结果初期有足够的水分供应。果实膨大后，应注意适当给水。2. 育苗或定植时将长势相同的放在一起，以防个别植株过大而缺水，引起脐腐病。3. 选用抗病品种，如番茄果皮光滑、果实较尖的品种，在易发生脐腐病的地区可选用。4. 地膜覆盖可保持土壤水分相对稳定，减少钙质养分淋失。5. 使用遮阳网覆盖，减少植株水分过分的蒸腾。6. 采用根外追施钙肥技术。
