苦瓜的根系发达，以侧根发生的须根为主，再生能力弱，喜湿而不耐涝。育苗期间需要85%左右的空气相对湿度和75%左右的土壤相对湿度。苗期需水较少，水分过多易引起徒长，植株瘦弱，抗性降低。生长期间要求70%～80%的空气相对湿度。各生育期对水分要求不同：发芽出土期土壤含水量宜保持在80%～85%，过干不利发芽，过湿易烂籽；幼苗期土壤湿度应保持在75%左右，过干易老化，过湿易徒长；抽蔓期植株对水肥吸收量大增，棚室栽培时应控制土壤湿度在65%左右，不干旱时不宜浇水，以免徒长。
防治措施包括：①选用抗（耐）病品种；②进行种子消毒；③实行轮作（最好水旱轮作）；④生长期定期喷施瓜菜用叶面肥，促进生长及壮苗抗病；⑤及时防治蚜虫、蓟马和白粉虱，防止传染；⑥发现病株及时拔除、烧毁，并喷施好普700倍预防；⑦发病初期及时药剂防治，可用2%宁南霉素300倍或马啉胍·乙酸铜1500-2000倍液喷施。
苦瓜病毒病危害幼苗和刚开花结瓜的植株，导致生长点萎缩、叶片卷曲、植株枯萎死亡。叶片开始卷曲时，应连续喷洒2-3次600倍植物病毒疫苗水溶液或600倍植物助壮素水溶液，每7-10天喷施一次。
