主要病理变化有：发病羊中等以上膘情，鼻腔流出黄色浓稠胶冻状鼻液，口腔流出带青草的唾液，僵尸一般，不臌气。发病特点以绵羊为多，山羊较少，通常为2-12月龄、膘情好的羊；经消化道发生内源性感染。羊肠毒血症的症状分为两类：一类以抽搐为特征，羊在倒毙前四肢强烈划动，肌肉颤搐，眼球转动，磨牙，2-4小时内死亡；另一类以昏迷和静静死亡为特征，病羊步态不稳，后卧地，感觉过敏，流延，上下颌“咯咯”作响，继而昏迷，角膜反射消失，有的可见腹泻，3-4小时内死亡。
病变常见于消化道、呼吸道、心血管系统。心包内有50-60ml灰黄色液体和纤维素絮块，肺充血水肿，肾脏软化如脑髓，肠道某些区段急性发红。真胃含有未消化的饲料，左心室心内外膜下有出血点，肺腑出血和水肿，肾脏充血、肿胀且柔软，胸腺常出血，大小肠出血。病程较长病例胃内充满未消化的饲草，胃壁黏膜脱落和溃疡，腹膜及肠浆膜下有出血斑点，肠管内充满大量气体和少量带血液体，肠黏膜脱落和溃疡。心脏肿大，心包内有混浊积液，心内外膜有小点出血，肾脏表面充血，实质松软如泥，略加触压即烂，胆囊肿大1~3倍，胆汁黏稠，小肠壁呈血红色，有的病例有溃疡。
