甜瓜叶枯病主要危害叶片，发病初期在叶背面叶缘或叶脉间出现水浸状小点，湿度大时导致叶片失水青枯，天气晴朗气温高时形成圆形至近圆形褐斑，布满叶面后融合成大斑，病部变薄形成叶枯。病情严重时叶片卷曲、枯死，病株呈红褐色。此病在坐瓜后期开始出现，糖分积累时达发病高峰，通常在中上部叶片发生。
茎蔓发病时产生菱形或椭圆形稍有凹陷的病斑。果实受害后，果面上出现圆形褐色的凹陷斑，常有裂纹，病原可逐渐侵入果肉，造成果实腐烂。发病初期，叶片上产生褪绿色小黄点，后扩展成圆形至椭圆形褐色病斑，中央灰白色，边缘深褐色至紫褐色，微微隆起，外缘油渍状。后期病斑中部有稀疏霉层，一张叶片常有病斑300个以上。
