枣锈病主要危害叶片，有时也侵害果实。发病初期，叶片背面多在中脉两侧及叶片尖端和基部散生淡绿色小点，渐形成暗黄褐色突起，即锈病菌的夏孢子堆。夏孢子堆埋生在表皮下，后期破裂，散放出黄色粉状物，即夏孢子。发展到后期，在叶正面与夏孢子堆相对的位置，出现绿色小点，使叶面呈现花叶状。病斑处有黄褐色夏孢子堆，成熟时突破表皮散出黄色粉状的夏孢子，后期在叶片正面对着夏孢子堆处出现不规则的绿色小点，形成褐色斑状，逐渐干枯脱落。发病严重时，枣树上的叶片全部脱落，只留下未成熟的青枣。冬孢子堆一般在秋季落叶以后发生，较夏孢子堆小，黑褐色，稍凸起，但不突破表皮。病菌多在病叶上越冬。6月下旬降雨后，越冬的孢子开始萌芽侵入叶片，7月中旬开始发病，8~9月份病菌不断进行再侵染，受害严重叶片开始大量落叶。树冠下部先落叶，逐渐向树冠上部发展。在落叶上有时形成冬孢子堆，黑褐色，稍突起，但不突破表皮。