莴苣菌核病主要危害结球莴苣的茎基部或茎用莴苣的基部。在莴苣整个生育期均发病，苗期发病，通常病情发展迅速，短时间即可造成幼苗成片腐烂倒伏。但发病盛期多出现在生长后期，植株近地面茎基部或接触土壤中衰老叶片边缘、叶柄先受害，病斑初为褐色水渍状，发展后成软腐状，并在被害部位密生棉絮状白色菌丝体，后期产生菌核。菌核初期为白色，后逐渐变为鼠粪状黑色颗粒状物。病株叶片凋萎，生长不良，呈青枯状萎焉，发病严重的植株常整株腐烂瘫倒。留种植株发病后期，剥开茎部，内壁可见有许多黑色菌核。通常菌核病引起的腐烂没有恶臭，有别于细菌性软腐，但若两病混发时，也会伴恶臭味。菌核病的主要鉴别特征是发病部位软腐，并产生棉絮状菌丝体和鼠粪状菌核。莴苣苗期和成株期都可发病。叶用莴苣多由靠近地表面的叶柄或下叶边缘开始表现症状，变为淡褐色水浸状，继而软化腐烂，天气潮湿时长出灰白色棉絮状物(病原菌的菌丝体)，以后絮状物中出现黑色鼠粪状菌核。天气干燥时，叶球外叶仍能保持原形，但呈黄褐色，薄纸状，叶球内部已经腐烂，有空隙和菌核。发病初时，植株近地面茎基部先受害。病斑初为褐色水渍状，后扩展至整个茎部，使茎基部软腐，并在被害部位密生棉絮状白色菌丝体，后期产生菌核，有时茎基部还会出现开裂的症状。莴笋染病后，植株下部叶片变软发褐，病害向上发展，上部叶片青枯状萎焉，茎秆发病，植株生长不良，重者整株枯死或倒伏。