菜豆根腐病的农业防治措施包括：(1)选择抗病品种，并与茄科、葫芦科等非豆科作物进行两年以上的轮作。(2)深翻土壤。冬季大棚菜豆收获后要及早深翻，深翻40厘米以上，翻地时间不能晚于定植前20天。(3)施足底肥。每亩施农家肥3000公斤或“二伽一”有机肥40公斤和高磷高钾复合肥75公斤，再加“免深耕”土壤调理剂2公斤。(4)采用高畦种植。结合土壤墒情起垄，一般以土不黏手时起垄为宜。起垄时两垄中心间距1米、垄沟宽0.3米、深0.15米。(5)合理灌溉。浇地前收听天气预报，在晴天或无雨多云天浇水为宜。加强田间管理：发现病株立即拔除，并在病穴內及四周撒施消石灰。采用高畦栽培，防止大水漫灌，雨季注意排除积水。实行轮作：有条件的地方与葱蒜类进行2年以上轮作。药剂防治：病地种植前药剂土壤消毒，药剂有50%福美双可湿性粉剂500—800克／亩，或90%敌克松原粉30—100克／亩，以上药剂拌上30公斤细土，整地时均匀撒施于土表层。发病初期根茎部浇洒药液，可用50%多菌灵600—800倍液；70%敌克松100倍液，轻轻松一下根茎周围的土，再浇灌。可以在根茎部喷75%百菌清50—600倍液；或70%甲基托布津800—1000倍液；50%苯莱特可湿性粉剂600—800倍液等灌根。平整土地，防止积水。采取高畦深沟栽培，降低田间湿度，提高地温，促进根系发育，增强抗病能力。菜豆根腐病是由因半知菌亚门镰孢属、菜豆腐皮镰孢真菌等微生物侵染导致的一种植物常见病。但是这病只要预防和治疗得当，危害是可以减轻。