一、加强检疫。二、加强栽培管理。三、推广抗病品种。四、合理轮作。五、化学防治，种子进行包衣；用甲基异柳磷防治。药剂防治重病田块可施药防治。要求将药剂施于表层20厘米的土壤中。可采用以下药剂：3%克百威(呋喃丹)颗粒剂每亩5公斤，或5%甲基异柳(硫)磷颗粒剂每亩8公斤，或10%力满库颗粒剂每亩3-4公斤，或15%涕灭威颗粒剂每亩700~1000克，用细土拌匀后施入土中。注意不要超过上述施药量，以免产生药害。以上农药毒性都较大，使用时注意安全。严禁加水制成悬浮液直接喷洒。
合理轮作由于线虫残留在土壤中，通过与非寄主作物的轮作、水旱轮作、抗病品种与感病品种的轮作都可以有效降低土壤中胞囊线虫的数量。应采用合理轮作为前，配合选用抗线虫品种和重点地块(地区)。
选育和利用抗病品种品种资源中的小黑豆、北京小黑豆等可作为抗源使用。吉林和黑龙江都已获得一些高世代的抗病品系。黑龙江的抗线一号适合在盐碱地重病区应用，1991年已开始推广。耐线虫品种在生产上利用虽可增产10-15%，但不能减少土中的胞囊数量，因此不能减轻以后的发病。
防治方法：(1)选用抗病品种。(2)病田种玉米或水稻后，胞囊量下降30%以上，是行之有效的农业防治措施，此外要避免连作、重茬，做到合理轮作。(3)药剂防治提倡施用甲基异柳磷水溶性颗粒剂，每亩300-400g有效成分，于播种时撒在沟内。
大豆保根菌剂每公顷所需大豆种子用液1500-2250ml拌种，以高剂量防效更好。也可每公顷1050千克与种肥混施。另外用豆丰1号生防颗粒剂，每公顷75-150千克，与种肥混施。
