1.实行科学轮作，避开茬口安排。根据病菌存活期，对病田实行5年以上水旱轮作，或与非十字花科作物如番茄、辣椒、茄子、南瓜、西葫芦、苦瓜、黄瓜、玉米、葱、蒜等轮作。在十字花科蔬菜根肿病盛发期（9-11月）不种植易感病的十字花科作物。2. 清除病株，减少田间菌源。收后或病田换茬时及时清除病株残体，带出田外深埋或烧毁。作物生长期田间发现病株要及时拔除，带出田外深埋或烧毁，并在病株塘撒施生石灰消毒。3. 推广深沟高畦栽培。采用深沟高畦栽培、抗旱小水勤浇，控制土壤湿度，减轻病害发生，避免大水漫灌。多施农家肥和磷钾肥，控制氮肥施用量，适当抑制病害发生。