水蝇以幼虫为害。幼虫孵化后即蛀入叶内取食叶肉，被害部位呈细长直线潜道。随着虫龄期增大，蛀入叶鞘为害，吃光叶肉只留表皮，麦叶枯黄，个别幼虫可蛀断生长点，造成枯心。大麦抽穗前后，蛀入剑叶或上部叶片的叶鞘内，使叶鞘枯白，造成叶片倒垂于茎上，早期枯黄。