推荐的肉鸭免疫程序：1日龄，使用鸭病毒性肝炎弱毒疫苗，20倍稀释后皮下或每只0.5毫升肌肉注射；7-10日龄，使用H5N1亚型禽流感灭活苗，皮下或肌肉注射；10日龄，使用鸭瘟弱毒疫苗，40倍稀释后每只0.2毫升肌肉注射；25日龄，使用禽霍乱油乳剂灭活苗，皮下注射或饮水免疫。自繁自养的规模化养殖场或公司性质的养殖，建议免疫种鸭，以提高小鸭的母源抗体。非自繁自养的养殖场或个体户需制定严格合理的免疫程序，并结合当地发病史等进行免疫。现有的肉白鸭疫苗主要有鸭病毒性肝炎弱毒疫苗、浆膜炎+大肠杆菌二联蜂胶苗、禽流感油乳苗等。肉番鸭还应免疫雏番鸭细小病毒病、小鹅瘟与花肝病弱毒疫苗。