玉米小斑病在玉米整个生育期内都可发生,但以抽雄、灌浆期发病严重。主要为害叶片,也侵染叶鞘、苞叶和果穗。在叶片上病斑较小,数量多,在高温多湿条件下,病斑表面密生一层灰色的霉状物,即病原菌分生孢子梗和分生孢子。病斑类型多样:一是椭圆形或近长方形,限于叶脉之间,黄褐色,边缘褐色或紫褐色,连片后叶片变黄枯死;二是椭圆形或纺锤形,较大,不受叶脉限制,灰色或黄褐色,边缘不明显,有的后期有轮纹,苗期发病时形成暗绿色浸润区,数量多时叶片迅速萎蔫死亡;三是黄褐色坏死小斑点,不扩大,周围有黄色晕圈,表面霉层少,多见于抗病品种。叶鞘和苞叶上病斑较大,纺锤型,黄褐色,边缘紫色或不明显,表面密生灰黑色霉层。果穗受害时,病部形成灰黑色霉区,严重时导致果穗腐烂,种子发黑腐烂,影响发芽和出苗,常致幼苗枯死。