番茄斑枯病多从植株下部叶片开始发生，叶正反面均出现圆形或近圆形病斑，边缘深褐色，中间灰白色，稍凹陷，果实上散生黑色小斑点，直径2-3毫米，呈鱼眼状。严重时布满全叶，导致叶片褪绿变黄。气温在15℃以上，遇阴雨天气易发病。番茄斑枯病典型症状是病斑小，呈鱼眼状，病斑上散生许多黑色小点，不同于斑点病和细菌性斑疹病症状。
番茄斑点病典型症状是坏死斑呈灰黄色或黄褐色，有轮纹或边缘有黄色晕，潮湿时着生暗灰色霉层。番茄细菌性斑疹病典型症状是病斑深褐色至黑褐色，有晕圈，叶缘和未成熟果实染病明显，潮湿冷凉、低温多雨、喷灌后有利于发病。
番茄斑枯病主要为害番茄的叶片、茎和花萼，尤其在开花结果期的叶片上发生最多，果实很少受害。接近地面的老叶先发病，逐渐蔓延到上部叶片。初发病时，叶片背面出现水浸状小圆斑，不久叶片正面出现近圆形的褪绿斑，边缘深褐色，中央灰白色，凹陷，密生黑色小粒点。发病严重时，叶片逐渐枯黄，植株早衰，造成早期落叶。茎部病斑椭圆形，稍隆起。病斑中间灰白色，边缘暗褐色。果实染病，病部灰白色，边缘暗褐色，呈圆形隆起，类似鱼眼状。
番茄斑枯病主要危害叶片，也能危害茎和花萼。叶片发病多从植株下部开始。病初在叶背面产生水浸状圆形小斑点，随后叶正、反两面出现圆形或近圆形病斑，边缘深褐色，中部灰白色，稍凹陷，并散生许多墨色小粒点，直径2-3毫米，病斑形似鱼眼。严重时叶片布满斑点，叶片退绿变黄，引起早期脱落。茎上病斑呈椭圆形，褐色。果实发病出现褐色圆形病斑。
番茄斑枯病在整个生育期均能发病，主要为害叶，茎与果实受害较少。叶上病斑圆形，边缘褐色，中间灰白色，叶上生小黑点，形如鱼眼。茎上病斑椭圆形、褐色。
