首先把金针菇根部切下来，容器中放入清水、1勺小苏打搅匀，铺一张化妆棉或湿纸巾，再把金针菇的根部放进去，用保鲜膜或纱布把容器口盖起来，放在阴暗潮湿的地方即可。接种时应选择菌丝洁白、健壮、无污染、适龄菌种，根据不同的栽培季节，选择优质、高产、抗逆性强、市场需求的适宜品种。当袋温降到25℃以下时方可接种。接种箱用气雾熏蒸消毒盒进行灭菌30分钟。接种用具用75%酒精消毒，接种时严格无菌操作。每瓶三级菌种接20-30袋，接种后移至菇棚上架。枝条菌种接种很简单，将菌袋内的打孔棒抽出来，然后将枝条菌种放在洞内，使用棉花或者海绵封口即可。