在玉米灌浆期开始根系发病，乳熟后期至蜡熟期为发病高峰期。从始见青枯病叶到全株枯萎，一般5～7天，发病快的仅需1～3天，长得的可持续15天以上。玉米茎腐病在乳熟后期常突然成片萎蔫死亡，因枯死植株呈青绿色，故称青枯病。先从根部受害，最初病菌在毛根上产生水渍状淡褐色病变，逐渐扩大至次生根，直到整个根系呈褐色腐烂，最后粗细根变成空心。玉米茎腐病主要为害根系和茎基，植株发病后，茎基部皮层会变成淡褐色或黑褐色，叶片变黄、萎缩，茎内木质部变成褐色。玉米茎基腐病一般从灌浆至乳熟期开始发病，乳熟末期至蜡熟期为显症高峰期，严重时可导致植株枯死。
青枯型茎基腐多在潮湿环境下引起急性发病症状，整株叶片在短时间内突然变为青灰色，失水干枯，果穗下垂，灌浆不足，茎基部发黄变褐，内部疏松，根系水渍状或红褐色腐烂。茎基腐烂型植株根系明显发育不良，根少而短，病株茎基部变软，剖茎检查，髓部空松，根茎基部及地面上1-3节间多出现黑色软腐，遇风易倒折，在潮湿时病部初期出现白色，后期为粉红色霉状物。果穗腐烂型有的果穗发病后下垂，穗柄变柔软，苞叶青枯、不易剥离，病穗籽粒排列松散，易脱粒，粒色晦暗无光泽。
茎和茎基部发病通常由根系发病，局部产生浅褐色水渍状病斑，随后逐渐扩展到整个根系，呈褐色腐烂状，最后根变空心，根毛稀少，植株易被拔起；植株茎基部2-3节由青绿色逐渐变成黄褐色，节间中空，茎节变成浅褐色，病部易破裂；潮湿环境下可以看到白色菌丝和粉红色霉层；植株较易倒伏。玉米茎基腐病主要危害中部叶茎和叶鞘，玉米10片叶时，叶梢上出现水渍状腐烂，病组织开始软化，散发出臭味。叶鞘上病斑呈不规则形，边缘浅红褐色，病健组织交界处水渍状尤为明显。湿度大时，病斑向上下迅速扩展，严重时植株常在发病后3-4天后病部以上倒折，溢出黄褐色腐臭菌液。病菌存于土壤中病残体上，自植株的气孔或伤口侵入。高温高湿，害虫为害造成伤口时发病严重。
