霉菌病包括霉菌、黄霉菌、白霉菌和绿霉菌等，通称杂菌病，常在高温、高湿、透气不良的环境中发生，对菌棒和天麻造成危害。防治方法：定期检查，发现霉菌后取出晒1～2天，用刀割掉霉菌寄生处，严重者应烧毁以防传染。霉菌对密环菌和天麻危害较大，连作及透水透气不良时，块茎会出现紫褐色病斑。防治措施：1.选择透水、透气性好的沙壤土栽培，避免熟地、粘土或涝渣积水地；2.发现杂菌感染的菌材应弃用，保持菌材纯净；3.栽种天麻与培养密环菌时，菌材间隙用沙土填实，避免积水生杂菌；4.加大菌种用量，促进密环菌生长，抑制杂菌。