贝母菌核病以菌丝体或菌核在土壤中或病残鳞茎上越冬。第2年春土壤温、湿度适宜时，开始萌发浸染植株，逐渐向四周蔓延。空气不传播此病。主要传播途径包括：田间除草松土过程中通过手或农具附带传播；牲畜进贝母园践踏传播；带病鱗茎异地移植传播；患病薤白传播；随着水的流动传播。其中，随着水的流动传播最为严重，在山坡地种植平贝母，上坡或中部感染菌核病，下坡和左右定会成为重灾区。
病毒病主要靠预防，首先要注意用蚍蚜酮或噻虫嗪兼治传毒媒介害虫如白粉虱、蚜虫等，加强肥水管理有利于抵抗病毒，发现少量病株及时拔除，避免传染。推荐配方为毒氟磷1200倍+5%氨基寡糖素600倍+3%啶虫咪1200倍+叶面肥或5%辛菌氨醋酸盐800倍+5%氨基寡糖素600+75%吡虫啉3000倍+叶面肥交替喷施，每7天一次，适当添加硫酸锌和叶面肥同喷可增加效果。
