成鸡与雏鸡分开喂养，以免带虫的成年鸡散播病原导致雏鸡爆发球虫病。加强饲养管理，保持鸡舍干燥、通风和鸡场卫生，定期清除粪便，堆放发酵以杀灭卵囊。保持饲料、饮水清洁，笼具、料槽、水槽定期消毒，一般每周一次，可用沸水、热蒸气或3%～5%热碱水等处理。
药物预防措施包括：
1.氯苯胍：预防按30～33毫克/千克浓度混饲，连用1～2个月，治疗按60～66毫克/千克混饲3～7天，后改预防量预以控制。
2.氨丙啉：可混饲或饮水给药，混饲预防浓度为100～125毫克/千克，连用2～4周。治疗浓度为250毫克/千克，连用1～2周，然后减半，连用2～4周。应用本药期间，应控制每千克饲料中维生素B1的含量以不超过10毫克为宜，以免降低药效。
3.硝苯酰胺(球痢灵)：混饲预防浓度为125毫克/千克，治疗浓度为250～300毫克/千克，连用3～5天。
4.莫能霉素：预防按80～125毫克/千克浓度混饲连用。
5.盐霉素(球虫粉，优素精)：预防按60～70毫克/千克浓度混饲连用。
6.地克珠利：预防按1PPM浓度混饲连用。
