病菌以菌丝体或菌核在土壤中或病残组织上越冬,腐生性较强,在土壤中可存活2-3年。病菌通常从伤口或表皮直接侵入幼茎,引起根部发病,借雨水或灌溉水传播。西红柿立枯病发病规律是病菌在土壤中或病残体中越冬或移夏,通过雨水、流水、农具以及堆肥传播。在适宜条件下,可直接侵入寄主。番茄立枯病主要发生在刚出土的幼苗及大苗,以育苗后期发生偏多。病苗茎基部变褐,后病部收缩细缢,茎叶萎垂枯死。稍大的幼苗白天萎蔫,夜间恢复,当病斑绕茎一周时,幼苗逐渐枯死,一般不倒伏。病部初生椭圆形暗褐色斑,有同心轮纹及淡褐色蛛丝状霉。