花椰菜菌核病发生与前茬作物密切相关。前茬若为十字花科、大豆、向日葵等连续种植多年的地块或花椰菜长期连作，会造成菌核在土壤中逐年累积，在适宜的气候条件下，增加菌核病的发病几率。调查前茬种植大豆的花椰菜地，结果表明，菌核病发病率比正常轮作田高出20—40%。花椰菜重茬发生率为15.5%，而且随着重茬年数的增加发病率增加，重茬3年的发病率高达50%。不同轮作模式对病害的发生也有不同影响，调查结果表明，大豆—花椰菜连作地块的子囊盘数量明显高于水稻—花椰菜连作地，即水旱轮作可以有效控制病害。病菌以菌核随病残体或混在种子间在土壤中越冬，春秋两季雨水偏多、潮湿的情况下，菌核萌发，产生子囊盘，借气流进行传播，病健植株接触也能进行传播。病害的发生与当地的相对湿度有密切的关系。在温度15—25℃、相对湿度70%以上时易发病。温、湿度适宜且无雨时，病害只在个别地块或局部发生。连续降雨2—3天时大部分地块发病，病害开始流行。据此推断，病害的流行可能是降雨提高了当地的相对湿度，从而利于病原菌的繁殖及侵染造成的。春天寒流来得早、低温持续时间长、阴雨连绵天气多、地势低洼易积水、种植密度过大、通风透光较差、氮肥施用偏多等均会造成该病较重发生。