实行2～3年以上轮作，不能轮作的重病地应进行深耕改土，以减少该病发生。种植密度适当，及时摘除下部老叶片，注意通风透光，低洼地应实行高畦栽培，雨后及时排水，收获后及时清园。发病初期开始喷洒50%敌菌灵可湿性粉剂500倍液、20%甲基立枯磷乳油1200倍液、36%甲基硫菌灵悬浮剂600倍液。此外用30%倍生乳油200×10-6～375×10-6灌根也有一定防治效果。也可施用移栽灵混剂。
苗床应建立在地势高燥、背风向阳、不易积水、土质疏松、肥沃的无病地块，切勿建在低洼潮湿的地块，以未种过芹菜的大田地块为宜，苗床内施用的土杂肥要充分腐熟，以防病菌带入育苗床内。为防止种子带菌传播病害，播种催芽前可用50~55℃的温水浸泡种子，浸泡时，要不停地搅拌，待水温降至30℃时，再进行浸种处理，可杀死种子上的病菌。
苗床的温度和湿度是病害发病的重要因素，而湿度又是关键因素，因此，以降低苗床的湿度，提高温度是防止病害发生的重要措施。播种前，可适当少浇水，以湿透10厘米土层为宜，播种后，还要及时扣好塑料薄膜，夜间加盖草苫，若气温过低可加厚草苫，也可在草苫上覆盖一层塑料薄膜以保温和防雨，使气温保持在15℃到20℃，防止苗床内长期处于1度以下的低温。此外，苗床内应尽量控制浇水，苗期干旱时，可在晴天的中午浇小水，并注意通风排湿，苗期还要注意及时间苗，以增强植株通风透光性，同时，苗床内还要经常撤施干燥的草木灰，既可降低苗床的湿度，又可吸热提温，而且草木灰还有抑制病原菌的作用。
采用药土护苗，用40％五氯硝基苯与50％福美双按1：1的比例混合，每方米苗床施药0.008千克加10～15千克细土或细沙拌匀。也可按照每平方米0.008到0.01千克50％多菌灵可湿性粉剂与5～8干克过筛的细土混合。播种时将1/3的药土铺在苗床底下，其余2/3的药土做种子的盖土，以保护种子。芹菜苗期发病后应及时拔除病株并喷药防治。75％百菌清可湿性粉剂700～800倍液，40％乙磷铝50～600倍液，72％普力克水剂600倍液，64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液喷雾效果较好。
