在大豆种子调运进程中要威严进行种子检疫，避免豆秆黑潜蝇虫卵带出疫区。在大豆繁种进程中建立种子田搞好除杂除劣和病虫害防治，提高种子品质，减少种子带虫卵数量。合理进行轮作倒茬，不给害虫留生存之地；秋收后清扫解决大豆秸秆和根茬，减少越冬虫卵。化学药剂防治，大豆苗期防治为重点，做到早防早治，可用50%辛硫磷乳油1000倍液喷洒植株，防效在90%以上；或用20%菊马乳油3000倍液及20%增效马氰乳油等喷洒植株，均有很好防治效果。
农业防治：要尽量选用早熟高产品种，不误农时早播，提高植株的抗虫性，以减轻受害；及时清理田园内的落花、落蕾、和落荚、病残植株体，以免转移为害；增施腐熟有机肥，适时间苗。
糖醋诱杀：在成虫盛发期，盆内放入红糖375克、醋500毫升、白酒125毫升、敌百虫0.5克加开水500毫升，稀释后放置田间，每20—30亩放一盆，上午6—9时，下午5—7时诱杀，可减轻危害。
药剂防治：主防成虫和初孵幼虫。可采用10%大功臣可湿性粉剂15—20克／亩或40%乐果乳油50—75毫升／亩，亦可用50%辛硫磷乳油50毫升／亩，兑水50公斤在豆苗盛花期开始连喷两次，每10天喷洒1次；在夏至后出苗则要提前到初花期开始喷洒，每10天喷1次，连喷3次即可。