大葱软腐病是由大葱球茎软腐病假单胞菌等原细菌引起的。病原在病组织中越冬,翌春经风雨、灌溉水及带菌土壤、肥料、昆虫等多种途径传播,从伤口或气孔、皮孔侵入。氮肥过多的田块和生长旺盛或虫伤的植株发病往往较重。高温高湿、机械伤、虫口伤容易引起病害流行。此病菌深入内部组织引起发病,通常大雨过后或连续阴雨天气,发病重;低洼连作地植株徒长,排水不良,病菌积累多,发病重;土壤板结易发病。该病的病原菌为唐菖蒲假单胞菌大葱致病变种(大葱球茎软腐病假单胞菌),为胡萝卜软腐欧氏杆菌,属细菌类。病菌在病残体和土壤中腐生,是田间的主要侵染源,一般种子不带菌。该病危害鳞茎,田间鳞茎膨大期,在1~2片外叶的下部,一般在假茎抽长期开始发病,先从脚叶的叶缘或中脉发病,初期在基部近地面处出现水渍状病斑,形成黄白色条斑,可贯穿整个叶片,温度高时,病部呈黄褐色软腐状,后逐渐向上部叶片扩展,进而外叶折披、软化腐烂,致全株枯黄。病害症状为大葱地上部分倒伏,容易拔起,茎下部腐烂,引起全株倒伏,并有恶臭。