甜瓜采收后应放在阴凉场所，待瓜温及呼吸作用降低后，贴商标、分级装箱等包装上市。包装一般用纸箱，纸箱的外侧要有通气孔，内衬垫碎纸屑，以使瓜果不在箱内晃动为原则。就近销售或短途运输的，采用常温运输，散装或编织袋、筐装；长途运输或出口运输必须采用纸箱包装及低温运输方法。
入库前晒瓜将采收后的甜瓜平摊在晒场上晾晒，目的是降低皮层的水分和果实的代谢强度。秋季是入库晒瓜的合适时期。机械冷藏库贮藏甜瓜的适宜温度是哈密瓜类品种3～4℃，白兰瓜和粗皮甜8℃（4.4℃出现冷害），空气相对湿度60%～70%。简易窖及通风库，利用秋冬季节库外温度低的特点，将低温鼓入，春季库外升温，应尽量减少换气，维持较长时间库内低温。
甜瓜贮藏时不宜堆码贮放和装箱，而应安装支架一层一层分开，单层贮放；或用3根挂绳一组，中间打3个结，每结处放一个甜瓜，这样挂吊的甜瓜四面通风，保鲜最好。
选一阴凉通风处并打扫干净，在地面和四周撒上石灰粉，接着在地面或架子上铺一层稻草或麦秸，然后将套上泡沫网套的瓜轻轻摆放3～4层，这样可储放15～20天。将套上泡沫网套的瓜先装入竹筐或柳条筐内（不要装满，上部留一些空间），再把筐交叉叠放于阴凉通风的室内，保持室温16～18℃，相对湿度80%～85%，可储藏20～25天。将套上泡沫网套的瓜装入有通气孔的纸箱内，经预冷后交叉叠放于冷藏库，保持温度4～5℃，相对湿度80%～85%，可储藏2～3个月。
