病菌主要以厚垣孢子留在土中越冬,翌年条件适宜时,病菌从芹菜的幼嫩细根入侵后,致寄主皮层破裂或腐烂,该菌侵入后多寄生在根或根颈及叶柄维管束中,由于菌丝大量繁殖,致营养物质或水分向上运输受到妨碍。该病潜育期20天左右,土温高或气温20~32℃利于发病,气温28℃发病重。低于7.7℃或高于36℃发病轻。生产上干燥地块或育苗畦易发病。病菌主要在土壤中越冬,翌年条件适宜时开始活跃。通过嫩根入侵,引发病害。主要发病条件为干燥、田间温度及土壤温度过高等,适宜发病的温度为28~32℃,病菌在36℃以上、7℃以下时发病率低。病原发育适温28℃左右。