菠菜病毒病的防治措施包括以下几个方面：
1.田块选择：选择远离种植十字花科菜田、黄瓜田的地块种植，以减少病毒源。
2.选用抗病品种：选择抗病、耐病品种，以降低病害发生的风险。
3.适时播种：秋季避免过早播种，上海地区一般秋季适宜的播种期为10-12月，播种迟病害轻。
4.栽培管理：施足有机肥，增施磷、钾肥，增强寄主抗病力。铲除田边杂草，拔除病株。遇有秋旱或春旱要适时浇水，控制发病。
5.注意查蚜、治蚜：幼苗出土后为减少蚜虫传播病毒病，勤查蚜虫发生动态，发现蚜虫，要每7-10天喷药防治蚜虫1次。灭蚜药剂可用40%乐果乳油1000-2000倍液；50%马拉硫磷乳油1000-1500倍液；速灭杀丁1000-1500倍液等。此外还可用银灰色遮阳网育苗避蚜防病。
6.药剂喷雾防治：出苗后施用植物动力2003或天缘叶肥，促进根系生长。田间始见发病初期，每隔7-10天用药预防，连续2-3次。高效、低毒、低残留防治用药：可选宁南霉素喷雾。常规防治用药：可选盐酸吗啉胍喷雾。具体用药量及倍数，须按照作物病害危害程度及各农药品种使用说明予以确定。
7.种子处理：播种前可用3%中生菌素可湿性粉剂按种子重量的1%拌种。
8.物理防治：在保护地挂银灰色布条，可起到避蚜作用。
9.综合防治：选择通风良好，远离萝卜、黄瓜的地块种植菠菜；遇到春旱和秋旱，应多浇水，可减轻发病；施足有机肥，增施磷、钾肥，提高抗病力。在冬季和早春应将田间、地边及垄沟的杂草清除干净，并彻底清除病株，并将其带到田外深埋或烧毁。
10. 药剂防治：及时用药剂防治蚜虫，特别是在菠菜苗期。可在发病前或发病初期喷20％的病毒A可湿性粉剂500倍液，或5％的菌毒清水剂300倍液、抗毒剂1号300倍液，增强免疫力。发病前或发病初期，及时选用20%盐酸吗啉胍·铜可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳油800～1000倍液、5%菌毒清水剂300倍液等喷雾，7～10天1次，连喷2～3次。但由于菠菜生长时间短，一般发病后很少用药，关键在于幼苗期治蚜，搞好预防。
