秸秆还田的主要方式有：①秸秆粉碎翻压还田；②小麦直播免耕稻草覆盖还田；③留高茬翻压还田；④堆腐还田；⑤秸秆翻压还田。秸秆还田可分为秸秆直接还田和秸秆间接还田。秸秆直接还田目前主要有三种方式，即机械粉碎翻压还田、覆盖还田和留高茬还田。水热条件好、土地平坦、机械化程度高的地区更加适宜秸秆直接粉碎翻压还田。华北地区除高寒山区，绝大部分地区可采用秸秆直接粉碎翻压还田。北方春玉米一熟地区一般与保护性耕作结合，可采取留高茬还田和秸秆覆盖还田。西南地区和长江中游地区的研究表明，水田宜于秸秆翻压和覆盖还田，旱作地宜于秸秆覆盖还田。浙江三熟制地区，将早稻草翻压还入晚稻田是该地的主要方式。秸秆间接还田包括秸秆沼肥还田、秸秆过腹还田、秸秆过腹沼肥还田、秸秆菌糠还田、秸秆菌糠沼肥还田、秸秆堆沤还田、外置式秸秆生物反应堆“气”、“渣”、“液”综合利用以及草木灰还田等8种主要方式。玉米秸秆还田也有两种方式：还田模式之一是以深松为基础的秸秆全量还田+下年免耕播种；还田模式之二是收割同时进行粉碎抛撒+碎混或翻埋作业。